预防接种不良反应是疑似预防接种异常反应（AEFI）的类型之一。我国2010年印发的《全国AEFI监测方案》对AEFI报告、调查诊断等监测流程和要求作了详细规定。当医疗机构、接种单位、药品不良反应监测机构等发现属于报告范围的AEFI后48小时内（死亡、严重残疾、群体性AEFI等在2小时内）向受种者所在地的县级疾控机构报告，后者通过全国AEFI信息管理系统进行网络报告；对需要进行调查诊断的，由县级疾控机构组织专家进行调查诊断；死亡、严重残疾、群体性AEFI反应、对社会有重大影响的AEFI，由市级或省级疾控机构组织调查诊断专家组进行调查诊断。各级疾控机构和药品不良反应监测机构可通过网络报告系统对AEFI监测信息进行实时监测、分析和评价。
